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¿Dónde puedo encontrar imágenes de microarrays?

¿Dónde puedo encontrar imágenes de microarrays?


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He investigado algunos de los enlaces a bases de datos de microarrays conocidas, como arrayTrack, ómnibus (NCBI), TCGA. Encuentro que cuando intento obtener imágenes de microarrays obtengo un formato de archivo exótico (como .sdf o .cel) o información de base de texto. ¿Alguien sabe de imágenes de microarrays disponibles públicamente (preferiblemente con metadatos también) en .svg, .png ">


Las imágenes de microarrays (al menos para las matrices de Illumina) vendrán en formato .tiff y son enormes en comparación con los formatos resumidos (.sdf / .cel). La mayoría de los lugares no archivarán las imágenes sin procesar (por lo que no las encontrará en línea) e incluso cuando ejecute el microarray, a menudo necesitará realizar una solicitud especial para generar imágenes sin procesar. iirc .jpg "> http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/affy.html

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/beadarray.html

http://master.bioconductor.org/help/course-materials/2007/BioC2007/labs/oligo/BioC2007-oligo.pdf


Ver el vídeo: Procesamiento de Microarray (Noviembre 2022).