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¿Cuál es la causa del desequilibrio de eslabonamiento "desequilibrado"?

¿Cuál es la causa del desequilibrio de eslabonamiento


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Con desequilibrio de ligamiento perfecto ($ D '= 1, R ^ 2 = 1 $), es posible que tenga la siguiente tabla de recuentos para los alelos:

B b A 100 0 a 0100

Con desequilibrio de ligamiento "parcial" ($ D '<1, R ^ 2 <1 $), verá algo como esto:

B b A 100 25 a 25 100

Pero a veces he visto el siguiente desequilibrio de enlace "desequilibrado" ($ D '= 1, R ^ 2 <1 $):

B b A 100 0 a 50100

¿Qué da lugar a este tipo de situación, donde aB ocurre, pero Ab ¿nunca lo hace? ¿Existe un nombre para este fenómeno? Cuál es una mejor medida del desequilibrio de ligamiento en este caso, el coeficiente LD normalizado $ D '$, o la correlación al cuadrado $ R ^ 2 $?


Esto puede ocurrir si el Ab El genotipo es letal, es decir, no observará individuos con un Ab genotipo.

La letalidad alélica es un mecanismo común que puede explicar la herencia no mendeliana de un rasgo.

Para la pregunta de qué métrica LD usar, esto es complicado. Bajo el supuesto de que la letalidad de los alelos está en juego, usted observó haplotipos perfectos, por lo que D '= 1 no sería incorrecto. Sin embargo, el coeficiente de correlación también es correcto en el sentido de que el SNP A no es un proxy perfecto para el SNP B.


Ver el vídeo: Vértigo y problemas de equilibrio - Síntomas (Noviembre 2022).